Kirk, Spock ve McCoy acil bir görev için Yıldızgemisi Atılgan'a çağrılırlar ve bir süre sonra kendilerini isyan halinde bir Volkanlının esiri olarak bulurlar. Volkanlının amacı evrenin sonundaki 'Büyük Bariyer'in ardında ne olduğunu keşfetmektir.

Yolculuk, giderek hayatın anlamını çözmeye dönük metafizik bir arayışa ve yaratılışın gizemini çözme çabasına dönüşür. Bir süre sonra da Klingonlular, Volkanlılar ve İnsanlar arasında bir karşılaşmaya dönüşecektir. Bu mücadelenin taraflarından biri de, kaçınılmaz olarak 'Tanrı' olarak adlandırabileceğimiz çok güçlü bir varlıktır.