Dünyaca ünlü okyanus bilimcisi Steve Zissou (Bill Murray) ve ekibi, son belgesel çekimleri sırasında Zissou’nun ortağını öldüren gizemli, ele geçirilmesi güç, hatta belki de var olmayan Jaguar Köpekbalığının peşine düşerler! Şimdi takımlarında yeni üyeleri de vardır.